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除此之外,鳄鱼还有一套坚固而柔韧的皮肤盔甲,背部骨化的皮肤除了起保护作用之外,还具有积累热量的作用,其内部充满细小的血管。
鳄鱼的听觉、视觉和嗅觉进化到了几乎完.美的程度。鳄鱼的耳孔和鼻孔都具备可移动的皮肤边缘,在它潜水时可以施加保护。它的眼睛有三层眼睑,外一层角质化的眼睑几乎不可移动,而下面一层皮质的眼睑在睡眠和攻击猎物的时候闭合。在潜水的时候,有一层透明的膜保护它的眼睛。
鳄鱼还有特殊的皮肤感觉器.官,它们是上下颌和眼睛附近皮肤上的微小孔隙(上颌内部的皮肤上也有发现)。在鳄鱼和长吻鳄中,皮肤感觉器.官还分布在腹部、尾巴根部和泄殖腔附近。虽然它们的功能还没有完全被搞清楚,不过人们推测它除了气味和触觉,还可以感受水的振动,所以鳄鱼可以在浑浊而不透明的水中进行捕猎。
鳄鱼是非常聪明的动物。它们的大脑在爬行动物中可以算是大和完.美的了,和鸟类大脑的结构非常相似。一些科学家认为鳄鱼的智力可以家鼠相比。